2009年至2010年，審計署駐蘭州特派辦先后在內蒙古自治區連續組織實施了2007年至2009年節能專項資金審計和電力、鋼鐵和水泥等重點行業節能減排專項審計調查兩個項目。針對審計調查報告和審計決定中所反映的各項問題，內蒙古自治區人民政府高度重視，責成相關職能部門積極整改。截至2011年7月底，審計調查所反映的問題已得到了有效的整改落實，規范了節能減排專項資金的管理和使用，推進了節能減排建設項目的實施，較好地實現了促進自治區節能減排工作取得實效的審計調查目標。
收回違規資金和規范專項資金審計調查報告反映問題后，內蒙古自治區人民政府責成相關責任部門和企業收回違規資金和規范專項資金，其中包括項目實施單位和企業套取、多得的節能減排專項資金、規范項目實施單位和企業合法使用專項資金。截至2011年7月底，相關資金已全部收回財政部門。
淘汰煉鐵落后產能。審計調查發現，由于當地政府履責不力等原因未能按期淘汰落后產能，影響了國家加快經濟發展方式轉變這一宏觀政策的落實。經審計調查報告反映后，地方人民政府按照審計調查報告的處理意見，責成職能部門堅決貫徹國家政策，限期拆除了落后煉鐵設施。
促進了節能減排建設項目的實施。通過兩個節能減排審計調查項目的實施，進一步促進了內蒙古自治區人民政府及其各職能部門對節能減排工作的重視，督促了十大節能工程項目建設，更好地發揮了審計的“免疫系統”功能。
